Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130116L18RikQ8BMV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms