Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga3Q8BMI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms