Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smndc1Q8BGT7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smndc1Q8BGT7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smndc1Q8BGT7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smndc1Q8BGT7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smndc1Q8BGT7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smndc1Q8BGT7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smndc1Q8BGT7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms