Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg4bQ8BGE6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4bQ8BGE6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms