Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms