Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms