Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srgap3Q812A2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms