Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4cQ811C2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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