Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfascQ810U3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfascQ810U3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms