Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Smim19Q80ZU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim19Q80ZU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim19Q80ZU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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