Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms