Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc28Q80XJ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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