Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr2eQ80UW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr2eQ80UW8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2eQ80UW8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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