Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube3cQ80U95 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3cQ80U95 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms