Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpbQ7TT50 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42bpbQ7TT50 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms