Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc93Q7TQK5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms