Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms