Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssh1Q76I79 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms