Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc88cQ6VGS5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms