Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms