Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfrkbQ6PIJ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfrkbQ6PIJ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms