Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup98Q6PFD9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms