Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms