Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms