Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Herc4Q6PAV2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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