Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mtss1lQ6P9S0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtss1lQ6P9S0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms