Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Szrd1Q6NXN1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms