Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HelbQ6NVF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HelbQ6NVF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms