Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdcd11Q6NS46 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms