Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KdsrQ6GV12 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KdsrQ6GV12 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms