Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpalpp1Q69ZC8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpalpp1Q69ZC8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms