Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim24Q64127 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms