Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pan3Q640Q5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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