Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CochQ62507 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CochQ62507 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CochQ62507 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CochQ62507 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CochQ62507 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms