Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa13Q62424 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa13Q62424 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxa13Q62424 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms