Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpd52Q62393 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms