Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sycp1Q62209 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms