Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim27Q62158 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim27Q62158 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms