Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms