Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms