Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AcanQ61282 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AcanQ61282 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms