Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trpc6Q61143 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trpc6Q61143 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Trpc6Q61143 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc6Q61143 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms