Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms