Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3Q60803 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms