Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samhd1Q60710 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms