Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms