Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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Tdrd5Q5VCS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd5Q5VCS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd5Q5VCS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd5Q5VCS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Tdrd5Q5VCS6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Tdrd5Q5VCS6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Tdrd5Q5VCS6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tdrd5Q5VCS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd5Q5VCS6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms