Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabl6Q5U3K5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rabl6Q5U3K5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabl6Q5U3K5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabl6Q5U3K5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rabl6Q5U3K5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms