Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam71bQ5STT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam71bQ5STT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms