Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps54Q5SPW0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms